1、應對風險和機遇的措施
風險:不確定性的影響。影響是指偏離預期，可以是正面的或負面的。需要注意的是，在策劃FSMS時，要同時確定風險和機遇，風險是負面的，會對組織產生消極影響，而機遇是正面的，會對組織起到正向促進的作用，二者與預期的結果之間存在的差異則具有不確定性。組織應接受這種不確定性的存在，在開展項目或制定措施時，應制定應急方案或留出應急處理的時間。
確定風險和機遇時，應考慮組織的內外部環境、相關方的需求和期望以及管理體系的范圍，考慮食品安全危害及危害控制中規定的相關過程要求。
因為組織內外部環境、相關方的需求和期望以及食品安全危害等都可能會發生變化，所以應及時識別變化，根據變化確定新的風險和機遇。
組織在確定風險和機遇后，可對風險進行評估，根據風險的等級確定是采取糾正，還是需要制定糾正措施，措施應規定責任人、實施時間、實施內容等，制定措施后，應由相關責任部門負責在計劃的時間內實施措施，并確定由誰來負責跟蹤、評估措施的有效性。
組織在應對風險和機遇并采取措施時應考慮食品安全的要求、顧客的要求以及組織所在食品鏈中相關方的要求，比如國家每年會出臺食品安全風險監測、食品安全監督抽檢的相關要求，每年也會修訂法律法規、標準等，組織制定措施時，首先應滿足這些法規、標準和要求，確保在合規的前提下控制風險;再比如，顧客要求產品包裝的安全性、要求及時處理客投訴等。
不同的組織對待風險的態度存在著較為明顯的差異，有些組織可能會規避風險、消除風險源、改變可能性和后果，有些組織可能會根據實際情況將風險分擔給其他相關方，有些組織可能更趨向于接受風險的挑戰，為尋求機遇而承擔風險、接受風險的存在，無論采取哪種措施，目的是實現對風險的有效管理，增加業務的可預見性，在確保食品安全的基礎上提高企業的預期利潤。
組織應根據其對應的風險等級，確定采取措施的優先順序以及是否需要采取糾正措施。
2、食品安全管理體系目標及其實現的策劃
制定目標應與食品安全方針保持一致，并考慮法律法規要求、顧客要求等食品安全要求。可以采用SMART原則:
S=specific:明確性，目標必須是具體的。
M=measurable:衡量性，目標必須是可以衡量的，應該有一組明確的數據，作為衡量是否達成目標的依據。食品安全管理體系要求目標在可行的情況下應可測量。
A=attainable:可實現性，目標必須在付出努力的情況下可以實現，避免設立過高或過低的目標。當目標過高，員工在付出極大努力的情況下也無法實現時，會產生挫折感，失去實現目標的信心，從而嚴重地影響員工的積極性，起不到對員工的激勵作用;目標過低，員工不費勁就能輕松實現，這樣的目標也起不到激勵作用，不能最大限度地調動員工的創造性和積極性，不能合理利用資源，促進企業發展。
R=realistic:相關性，目標是實實在在的，可以證明和觀察，并且與本職工作相關聯。
T=time-based:時限性，目標必須具有明確的截止期限。
目標分為長期目標、中期目標、短期目標。一般說來，短期目標服從于中期目標，中期目標服從于長期目標。長期目標與戰略的時間跨度應當保持一致。
對制定的目標應進行監視和驗證。策劃目標時需策劃好目標監視和驗證的方法，比如每季度對目標的實現情況進行考核。
制定、發布目標時，應與相關責任部門、人員進行溝通，以便達成共識，并確保相關責任部門及時為實現目標落實責任人，制定針對性的措施，以確保目標的實現。
因為組織的不斷發展，內外部環境及管理要求等的不斷變化，目標也應根據這些變化適時進行更新。比如每年末對本年度目標進行評估，并根據下一年度組織經營計劃、發展戰略、體系管理要求等更新目標，在每季度前也可對目標提出更改意見，進行評估后確定是否對目標進行修訂。
針對制定好的食品安全目標，組織應策劃為實現目標應采取的措施，確定為實現目標要做什么，做多少，做到什么程度，需要什么資源，比如需要哪些部門支持，需要提供培訓，需要尋找專家，需要購買或更新設施、設備，需要信息技術支持等。根據所確定的事項、崗位職責以及人員能力等確定誰來負責實施措施，在什么時間內完成措施，如何評價措施完成情況以及目標實現情況。
目標實現情況的評價，鑒于監督的要求以及專業技術水平的要求，一般由確定的主導部門組織多部門共同進行評價。
3、變更的策劃
當組織確定需要對食品安全管理體系進行變更時，如人員變更、工藝變更、設施設備變更、信息系統變更、供應商變更、產品變更等，應策劃變更的方式、實施方法，并與相關人員進行溝通。
在策劃變更時，應考慮變更的目的和潛在的后果(如是否存在違規風險，是否存在對食品安全產生不良影響的風險等)。變更需保持食品安全管理體系的完整性，并且需識別變更所需的資源，以及這些所需的資源是否可以獲得，應根據不同的變更分配相應的職責和權限，必要時再分配職責和權限。
